对于男方1988年农历十一月十六出生和女方1988年农历五月出生的两人，想要测算结婚的吉日，需要结合两人的生辰八字进行详细的推算。这需要查阅专业的命理书籍或请教资深的命理师进行详细分析。
在八字合婚的测算中，一般会考虑二人的年柱、月柱、日柱和时柱，综合分析五行的相生相克关系，以及二人的命理特点。这个过程会考虑很多因素，包括天干地支的相性、命局中的喜用神、夫妻宫的状况等。
结合两人的八字，我们可以得出一些初步的判断。由于具体的八字未给出，这里只能简要分析。一般来说，在农历的一些特定日子里，比如农历的某些特定月份或者特定的星期几，可能会被认为是结婚的吉日。这还需要根据两人的具体八字来进一步确定。
在选择结婚吉日时，除了生辰八字的影响外，还需要考虑其他因素，如双方的工作、家庭安排以及当地的习俗等。最终选择的吉日应该是综合各种因素后得出的结果。